A kötelezettségszegési eljárás megindítását megelőzően Magyarország és Szlovákia 2015 decemberében megsemmisítési keresetet indított az Európai Unió működéséről szóló szerződés vonatkozó cikke alapján a tagállamokat képviselő miniszteri Tanács többségi döntésével elfogadott, a menedékkérők áthelyezéséről szóló határozat ellen. Így Magyarországnak Olaszország és Görögország tehermentesítésére mindösszesen 1294 nemzetközi védelemre szoruló menedékkérőt kellene befogadnia.
Az ügyben a magyar kormány a szlovákkal együtt ellentámadással indított és perelt a döntés ellen, azonban az Európai Bíróság tavaly szeptember 6-án elutasította Magyarország keresetét, egyben érvényben tartotta a határozatot. Közben az eljárástól függetlenül az intézkedés jogerős volt és végre kellett volna hajtani, ezért az Európai Bizottság az ilyenkor szokásos módon kötelezettségszegési eljárást indított. Ez egy darabig úgy nézett ki, hogy Brüsszelből küldtek egy felszólítást, amire a magyar kormány válaszolt, utána jött egy viszontválasz, és így tovább, de megegyezés híján megint az Európai Bíróságon kötöttek ki.